Cota cu tarif preferențial (Preferential quota) este utilizată în special în cadrul acordului de comerț liber. O astfel de cotă presupune aplicarea unor taxe vamale preferențiale pentru produsele acoperite de acord. Țările care aderă la aceste acorduri își acordă reciproc un regim vamal preferențial. Aceste țări pot exporta și importa în condiții similare. În relațiile cu țările terțe, acestea vor putea utiliza în continuare bariere vamale și cote pentru descurajarea importurilor. Nivelul la care se aplică o cotă cu tarif preferențial este stabilit în urma negocierii dintre țările participante la acordul de comerț liber.